More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0684 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.8 
 
 		 381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 489 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.81 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.25 
 
 		 745 aa  101  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 		 567 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  39.57 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  43.58 
 
 		 320 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.05 
 
 		 416 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.71 
 
 		 441 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  49.58 
 
 		 327 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.15 
 
 		 309 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  45.21 
 
 		 264 aa  94.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  40.13 
 
 		 727 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.52 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 		 340 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 		 517 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.62 
 
 		 449 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  43.26 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 		 332 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  47.97 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.42 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 401 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.35 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  42.07 
 
 		 433 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  39.46 
 
 		 401 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 		 776 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.92 
 
 		 1033 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 333 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  43.42 
 
 		 268 aa  88.6  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.3 
 
 		 343 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.3 
 
 		 343 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 448 aa  88.6  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 521 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 336 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 294 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 336 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.52 
 
 		 576 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  35.84 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.76 
 
 		 862 aa  86.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.9 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 381 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  36.7 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 273 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  47.93 
 
 		 973 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.84 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  39.07 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  37.64 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.98 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.14 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  42.18 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.04 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  42.18 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  40.36 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  44.62 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 900 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  44.62 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  39.72 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  39.72 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  42.54 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 		 706 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.48 
 
 		 525 aa  82.4  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.54 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  37.91 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  45 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  40.56 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.31 
 
 		 389 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.1 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.88 
 
 		 600 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>