More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1024 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 389 aa  769    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 862 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.71 
 
 		 576 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.3 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.7 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.48 
 
 		 264 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.11 
 
 		 517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.17 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.63 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  38.36 
 
 		 268 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.63 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.6 
 
 		 489 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.03 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 515 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.15 
 
 		 493 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.85 
 
 		 286 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1191 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.08 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.65 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 567 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  33.69 
 
 		 483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.24 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 		 635 aa  113  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.98 
 
 		 776 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.46 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  35.74 
 
 		 872 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 949 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  36.91 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  33.44 
 
 		 825 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  33.44 
 
 		 825 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  33.44 
 
 		 825 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  33.44 
 
 		 825 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.21 
 
 		 234 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.35 
 
 		 870 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  33.23 
 
 		 825 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  30.87 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.58 
 
 		 213 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.63 
 
 		 607 aa  107  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  31.23 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.55 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 		 825 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 233 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 		 862 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 233 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  33.96 
 
 		 213 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  28.78 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 		 184 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.18 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.8 
 
 		 844 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 		 216 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.06 
 
 		 277 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33.19 
 
 		 262 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.19 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  28.73 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.52 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.88 
 
 		 1033 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 		 309 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.87 
 
 		 745 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 		 214 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.97 
 
 		 14916 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  23.93 
 
 		 601 aa  99.8  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  32.92 
 
 		 710 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 		 250 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  35 
 
 		 239 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 		 877 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 		 880 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>