More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1704 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  99.64 
 
 		 825 aa  1649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  99.39 
 
 		 825 aa  1644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  99.64 
 
 		 825 aa  1649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 862 aa  1728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  99.76 
 
 		 825 aa  1650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  99.64 
 
 		 825 aa  1649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  99.64 
 
 		 825 aa  1649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  35.74 
 
 		 844 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  35.15 
 
 		 846 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 866 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 886 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  36.22 
 
 		 881 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  36.37 
 
 		 872 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.41 
 
 		 870 aa  353  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  22.43 
 
 		 976 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 949 aa  154  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.94 
 
 		 449 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.85 
 
 		 381 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 		 309 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 		 348 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.01 
 
 		 311 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 		 389 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 351 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 862 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1191 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 521 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.42 
 
 		 493 aa  97.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 440 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.43 
 
 		 401 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 356 aa  94.7  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 		 268 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.96 
 
 		 291 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.43 
 
 		 401 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.88 
 
 		 294 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.23 
 
 		 517 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.93 
 
 		 448 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 340 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 		 291 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 446 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 877 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.07 
 
 		 336 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 333 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.07 
 
 		 336 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.07 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 880 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 880 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.07 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 880 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.39 
 
 		 880 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.74 
 
 		 349 aa  89.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 880 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 		 285 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.53 
 
 		 356 aa  88.2  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 343 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 343 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 343 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  30.72 
 
 		 408 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 264 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 483 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  27.14 
 
 		 337 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  28.99 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.04 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  25.54 
 
 		 442 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.69 
 
 		 320 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  28.63 
 
 		 335 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 370 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  32.28 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.74 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 		 367 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 		 367 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 262 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  80.5  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  29.28 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  27.63 
 
 		 267 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  27.84 
 
 		 262 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.06 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.69 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 14916 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.02 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.43 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.43 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.43 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>