More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2868 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 370 aa  745    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  42.18 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  36.83 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  35.51 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  34.28 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  34.28 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  33.99 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  33.99 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  33.99 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  33.53 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  30.79 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  30.51 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  31.07 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  31.07 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  31.07 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  30.88 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.39 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.77 
 
 		 309 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 		 866 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 844 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.17 
 
 		 872 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.86 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.05 
 
 		 521 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.89 
 
 		 846 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.74 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.75 
 
 		 862 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.83 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25.07 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 254 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  27.31 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.65 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.31 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 825 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 825 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 825 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 825 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  26.38 
 
 		 870 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.96 
 
 		 862 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 880 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.51 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.47 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 949 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  27.65 
 
 		 880 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 825 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 872 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 877 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  19.41 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  27.24 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.18 
 
 		 710 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 976 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  32.96 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.64 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  24.27 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.69 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  19.12 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  22.48 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>