More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2842 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
242 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  91.32 
 
 
242 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  56.93 
 
 
233 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  50.22 
 
 
232 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  49.09 
 
 
229 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  48.73 
 
 
224 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 
243 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.56 
 
 
381 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.12 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.28 
 
 
734 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  33.47 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.16 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 
370 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
567 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 
359 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  30.86 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28 
 
 
600 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.8 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  33.91 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.8 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.95 
 
 
521 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.45 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  31.61 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  28.88 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 
1191 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.3 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.79 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  26.36 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 
976 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  33.5 
 
 
880 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.79 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  29.38 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  30.46 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  31.69 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.91 
 
 
493 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 
442 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.15 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.63 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  33 
 
 
880 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  26.42 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  29.9 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 
862 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.48 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  34.22 
 
 
870 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.69 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  31.64 
 
 
776 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
710 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.48 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 
872 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 
419 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
1033 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.03 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.92 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>