More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2443 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  65.44 
 
 		 844 aa  1169    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  100 
 
 		 846 aa  1757    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  38.51 
 
 		 886 aa  602  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  39.54 
 
 		 866 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 881 aa  572  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 872 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  35.15 
 
 		 825 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  35.15 
 
 		 862 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  35.15 
 
 		 825 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 870 aa  362  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 		 976 aa  233  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 949 aa  198  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.87 
 
 		 381 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 880 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 877 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 880 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 880 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 880 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.11 
 
 		 880 aa  121  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 872 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 		 449 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 576 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  32.55 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 521 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 309 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.18 
 
 		 319 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  29.1 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  29.49 
 
 		 343 aa  99.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 		 351 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.93 
 
 		 311 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 389 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 		 517 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.16 
 
 		 862 aa  94.7  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.92 
 
 		 340 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.9 
 
 		 515 aa  94  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28 
 
 		 332 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 448 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 359 aa  90.9  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.03 
 
 		 440 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.89 
 
 		 370 aa  89.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.15 
 
 		 483 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 360 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.09 
 
 		 734 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 446 aa  89  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.73 
 
 		 348 aa  89  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 567 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 360 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 295 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 493 aa  87.8  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1191 aa  87.8  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 		 320 aa  87.8  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 360 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.85 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 489 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  30.4 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  26.33 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  25.2 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  27.93 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.48 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.48 
 
 		 401 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 386 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.72 
 
 		 336 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.72 
 
 		 336 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  28.8 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.42 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  32.58 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.88 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.79 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  34.16 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 		 433 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  25.44 
 
 		 408 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  24.03 
 
 		 727 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 447 aa  77  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 356 aa  77  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 355 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  34.64 
 
 		 433 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 		 452 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 		 420 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>