More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0612 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
880 aa  1698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  99.43 
 
 
880 aa  1686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
880 aa  1698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  74.83 
 
 
872 aa  1136    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  99.43 
 
 
880 aa  1687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
880 aa  1698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  99.09 
 
 
877 aa  1536    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.89 
 
 
844 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  21.31 
 
 
976 aa  154  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
825 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
825 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.97 
 
 
381 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.4 
 
 
846 aa  121  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.69 
 
 
449 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 
448 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 
340 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.87 
 
 
601 aa  117  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 
351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.02 
 
 
309 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 
521 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 
949 aa  110  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 
332 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.27 
 
 
336 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.27 
 
 
336 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.7 
 
 
870 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.03 
 
 
881 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.6 
 
 
311 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.94 
 
 
872 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.04 
 
 
489 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 
1191 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 
862 aa  99  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
264 aa  98.6  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 
866 aa  97.8  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 
389 aa  97.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 
493 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 
440 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 
268 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.5 
 
 
320 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.01 
 
 
886 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.96 
 
 
576 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 
319 aa  94.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
517 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 
333 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 
343 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 
343 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  92.8  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 
635 aa  92.4  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  92.8  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  92.8  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 
447 aa  92.8  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  92.8  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
420 aa  92.8  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.46 
 
 
600 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.84 
 
 
515 aa  91.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 
493 aa  91.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.84 
 
 
862 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.31 
 
 
727 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.27 
 
 
234 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 
267 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.55 
 
 
14916 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.97 
 
 
348 aa  89.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 
401 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.86 
 
 
401 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
567 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.91 
 
 
446 aa  88.2  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 
408 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 
367 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.62 
 
 
607 aa  87.4  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 
367 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.95 
 
 
485 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 
657 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.05 
 
 
285 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.91 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 
360 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
354 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 
291 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 
295 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 
360 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 
710 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30 
 
 
734 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 
360 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 
359 aa  82  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  23.86 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  23.86 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.63 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  29.18 
 
 
776 aa  81.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  30 
 
 
360 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.52 
 
 
294 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  30 
 
 
360 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>