More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4190 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 356 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  63.1 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  37.22 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 349 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  35.51 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  32.85 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  30.03 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  30.03 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  30.03 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.01 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  28.37 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.32 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  27.45 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  27.45 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  27.45 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  27.17 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 825 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 825 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  27.09 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 825 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 825 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 825 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 825 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 576 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 862 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.38 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  25.77 
 
 		 886 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 866 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 949 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  21.27 
 
 		 448 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 521 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 		 862 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.6 
 
 		 872 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  23.66 
 
 		 870 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  23.95 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 844 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  21.38 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.29 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  20.85 
 
 		 607 aa  76.3  0.0000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  27.04 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  19.32 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.15 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  24.75 
 
 		 881 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.23 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  20.33 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.7 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  23.1 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  23.24 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  23.24 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.51 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.57 
 
 		 600 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  24.25 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  21.58 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 162 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  23.7 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1191 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  24.3 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  21.03 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  30.46 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  25.1 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 231 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  24.6 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  25.11 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  25.11 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.58 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.5 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>