More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1682 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  99.44 
 
 		 354 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  98.87 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  98.87 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  84.18 
 
 		 354 aa  564  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 358 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.9 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.39 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.44 
 
 		 870 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.7 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.44 
 
 		 872 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.36 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.36 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 521 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 844 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.87 
 
 		 517 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  30.84 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 		 881 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 862 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 		 493 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.71 
 
 		 440 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.73 
 
 		 949 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.84 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 		 976 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1191 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.55 
 
 		 576 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 862 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.09 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  28 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.75 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  28 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  28 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.75 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 		 886 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  32.86 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.52 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  20.94 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 866 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  39.32 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.4 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.8 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.8 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.1 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  36.91 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.01 
 
 		 635 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.92 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  29.13 
 
 		 846 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.34 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.51 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>