More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2034 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  98.87 
 
 
354 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
354 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  98.87 
 
 
354 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  98.87 
 
 
354 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  98.87 
 
 
354 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  98.87 
 
 
354 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  84.18 
 
 
354 aa  564  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 
348 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 
358 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31 
 
 
449 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.19 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  28.37 
 
 
356 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 
333 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 
448 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 
870 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.7 
 
 
356 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.36 
 
 
336 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.36 
 
 
336 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.7 
 
 
340 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.44 
 
 
872 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 
844 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 
521 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 
517 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.72 
 
 
862 aa  92.4  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.94 
 
 
881 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
493 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.36 
 
 
949 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 
351 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.45 
 
 
576 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 
976 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.6 
 
 
291 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.6 
 
 
291 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 
1191 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
862 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
825 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  24.34 
 
 
440 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
825 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  29.23 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 
886 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  32.86 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.7 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.07 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.2 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.07 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.79 
 
 
311 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 
515 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.26 
 
 
607 aa  77  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 
866 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  37.34 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.26 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.74 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  20.62 
 
 
601 aa  73.9  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.1 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.8 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 
227 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  29.13 
 
 
846 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  24.44 
 
 
706 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28.11 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.69 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>