More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2588 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  61.74 
 
 		 254 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.15 
 
 		 1033 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 900 aa  81.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.53 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 319 aa  77.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.94 
 
 		 449 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 		 567 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  38.94 
 
 		 381 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.83 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.64 
 
 		 734 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  36.94 
 
 		 710 aa  71.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 		 267 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.25 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.19 
 
 		 903 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  34.96 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.96 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  35.54 
 
 		 973 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  38.53 
 
 		 452 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  32.52 
 
 		 745 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.63 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.59 
 
 		 525 aa  68.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  36.72 
 
 		 362 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  45.16 
 
 		 576 aa  67.8  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 260 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 433 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 263 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 517 aa  67.4  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 		 320 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 199 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.65 
 
 		 14916 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  34.81 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.6 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  34.17 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  34.25 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  35.04 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  40.3 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 		 493 aa  65.1  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 872 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 		 340 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 441 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.38 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 401 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 411 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 456 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 		 412 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  36.28 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 		 830 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.59 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  36.54 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  32.12 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  36.54 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  33.91 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.35 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1191 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  29.93 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.21 
 
 		 485 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  32.26 
 
 		 325 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.07 
 
 		 870 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>