More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0401 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 
449 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
567 aa  118  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.91 
 
 
401 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.49 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.86 
 
 
381 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.74 
 
 
309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.05 
 
 
1033 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  45.73 
 
 
175 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  43.92 
 
 
267 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.67 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  34.73 
 
 
710 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  45.9 
 
 
264 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.44 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.17 
 
 
320 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.21 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.03 
 
 
745 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.68 
 
 
517 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.44 
 
 
225 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
340 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.99 
 
 
213 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.09 
 
 
521 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  42.78 
 
 
268 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.08 
 
 
343 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.08 
 
 
343 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 
262 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.92 
 
 
576 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 
262 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  47.56 
 
 
222 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 
401 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  46.27 
 
 
145 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 
401 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 
214 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39.3 
 
 
219 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 
216 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.87 
 
 
351 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 
389 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.13 
 
 
386 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 
311 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.82 
 
 
440 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  48.25 
 
 
277 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  42.37 
 
 
734 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 
441 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.19 
 
 
234 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.22 
 
 
336 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.22 
 
 
336 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
279 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
279 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.1 
 
 
525 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  43.37 
 
 
190 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 
515 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  42.94 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  51.18 
 
 
152 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  43.85 
 
 
149 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.63 
 
 
489 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.02 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 
493 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 
448 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 
862 aa  97.1  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  43.85 
 
 
149 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 
416 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  39.89 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.07 
 
 
412 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  38.71 
 
 
366 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.47 
 
 
300 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  49.6 
 
 
168 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  38.71 
 
 
350 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.5 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  34.63 
 
 
332 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 
291 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  40.61 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.36 
 
 
182 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.7 
 
 
203 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 
870 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  36.99 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 
903 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  46.56 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 
218 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 
184 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  35.86 
 
 
433 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  35.56 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
727 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  37.38 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50.42 
 
 
973 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 
493 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.65 
 
 
446 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  42.51 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  38.17 
 
 
366 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.54 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  38.17 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.88 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 
294 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>