More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2144 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
245 aa  480  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.15 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.61 
 
 
903 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 
1033 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  49.68 
 
 
386 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  49.65 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  42.86 
 
 
234 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  49.36 
 
 
449 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
416 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  39.89 
 
 
309 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 
446 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  42.48 
 
 
366 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.08 
 
 
213 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 
175 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 
433 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.99 
 
 
225 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.98 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
441 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  47.79 
 
 
320 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  47.3 
 
 
493 aa  99.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.57 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
567 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  41.96 
 
 
366 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  41.96 
 
 
366 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 
448 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.45 
 
 
184 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  42.24 
 
 
447 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  51.15 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  51.15 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.14 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.71 
 
 
745 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  40.99 
 
 
900 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  47.93 
 
 
180 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  42.94 
 
 
440 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  46.53 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.51 
 
 
340 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  46.53 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.75 
 
 
576 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 
182 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.54 
 
 
517 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
389 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.72 
 
 
286 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  51.22 
 
 
521 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.67 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 
401 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.08 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 
401 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
312 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
184 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  51.67 
 
 
182 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.81 
 
 
309 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  39.74 
 
 
381 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  41.26 
 
 
366 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  41.78 
 
 
706 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  39.51 
 
 
350 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
710 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
401 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
401 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 
450 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  30.62 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  42.19 
 
 
381 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  44.63 
 
 
143 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
294 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
219 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.07 
 
 
222 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  40.28 
 
 
734 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 
311 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 
333 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
174 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  41.72 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  45.58 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 
356 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  44.2 
 
 
332 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.42 
 
 
408 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  33.17 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 
146 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  43.51 
 
 
165 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  42.18 
 
 
179 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  52.21 
 
 
250 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  43.92 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  41.27 
 
 
727 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.14 
 
 
216 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  37.06 
 
 
315 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>