More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4189 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  59.01 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  59.01 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  47.56 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.92 
 
 		 343 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.92 
 
 		 343 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.21 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.35 
 
 		 1033 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50.66 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.81 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 168 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 		 401 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  39 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 		 401 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.16 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.25 
 
 		 449 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 		 576 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  37.88 
 
 		 440 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 862 aa  92.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.68 
 
 		 311 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 		 389 aa  91.7  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 401 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 401 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50.81 
 
 		 973 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 		 336 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.01 
 
 		 320 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 		 336 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  40.13 
 
 		 870 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.61 
 
 		 381 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 416 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.99 
 
 		 268 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  34.18 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  38.8 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 333 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 		 278 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 		 456 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 		 727 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  40.61 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  40.38 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.34 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.4 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.13 
 
 		 745 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  40.38 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.67 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 432 aa  81.6  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 		 517 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  37.21 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  32.26 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  33.56 
 
 		 866 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.51 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  38.98 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 903 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  32.71 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  37.58 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  38.56 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.57 
 
 		 706 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  37.41 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 681 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 776 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  37.8 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  39.46 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  44.24 
 
 		 1191 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  30.88 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  37.59 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  34.31 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 844 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  36.04 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  50.96 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  34.88 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.22 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>