More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0020 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  67.19 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  47.88 
 
 
259 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  50.88 
 
 
261 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  50.88 
 
 
261 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  44.36 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 
266 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  36.79 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 
145 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  54.05 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  61.11 
 
 
1033 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  50.49 
 
 
149 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  50.49 
 
 
149 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 
151 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  48.57 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 
145 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 
145 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  48.82 
 
 
340 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  50.44 
 
 
241 aa  89  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 
182 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.57 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  46.49 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  58.24 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  54.74 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  49.57 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  58.95 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  50.55 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  47.46 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  47.93 
 
 
146 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  37.99 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  42.19 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  47.92 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  49.07 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  41.6 
 
 
219 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 
567 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.22 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  49.46 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  49.48 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  51.06 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  45.28 
 
 
152 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  54.74 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
900 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
320 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  48.57 
 
 
745 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  53.68 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  51.61 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.4 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  51.09 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  46.73 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  45.31 
 
 
517 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  51.09 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  45.87 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  40.46 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  52.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  47.52 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  40.83 
 
 
885 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  53.33 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  46.3 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  45.19 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.72 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  52.58 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  51.02 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  52.17 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  48.18 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40.8 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  48.04 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  41.29 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40.8 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  46.23 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  46.23 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  53.06 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  48.89 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  47.87 
 
 
824 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  49.47 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  48.89 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  44.79 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.4 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  45.74 
 
 
830 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  50.65 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  52.81 
 
 
206 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  52.81 
 
 
206 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  50.54 
 
 
240 aa  72  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  49.49 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  47.66 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>