More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0195 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  272  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  54.55 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  54.55 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  55.04 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  56.56 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  56.56 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  48.25 
 
 		 151 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  51.22 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  50.86 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  46.83 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  47.79 
 
 		 190 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 241 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  51.49 
 
 		 1033 aa  94  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  51.89 
 
 		 449 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.56 
 
 		 256 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 		 259 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50.91 
 
 		 277 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 401 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 401 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 401 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 401 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 		 225 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  49.57 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 973 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.81 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.03 
 
 		 213 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  53.06 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  48 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  44.76 
 
 		 493 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  43.51 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 		 386 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  49.52 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  53.68 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.28 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  53.68 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  53.68 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.71 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  53.68 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 447 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 		 567 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 309 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  43.44 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  49.48 
 
 		 286 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  40.77 
 
 		 681 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  47.78 
 
 		 267 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.86 
 
 		 521 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 		 824 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 		 250 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 		 825 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  51.06 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  40.15 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  50.52 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  37.19 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  50.54 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  45.3 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  48.96 
 
 		 343 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  44.14 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 206 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  51.81 
 
 		 331 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  48.96 
 
 		 343 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  48.35 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  48.35 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.08 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.52 
 
 		 332 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  51.58 
 
 		 862 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 489 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 576 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  47.92 
 
 		 745 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  40.5 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 		 340 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 		 866 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.87 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  43.01 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  45.74 
 
 		 448 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  47.87 
 
 		 862 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 		 204 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  47.52 
 
 		 182 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 		 540 aa  70.1  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  42.99 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  35.83 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  47.67 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>