More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4786 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  51.7 
 
 
726 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  61.2 
 
 
830 aa  1056    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  60.95 
 
 
830 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
824 aa  1706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  51.84 
 
 
726 aa  746    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  30.8 
 
 
702 aa  227  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  29.78 
 
 
710 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  27.89 
 
 
719 aa  184  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  27.17 
 
 
720 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  25.88 
 
 
723 aa  178  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  63.51 
 
 
206 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  63.51 
 
 
206 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  51.46 
 
 
194 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  46.09 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.66 
 
 
184 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
195 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  48.51 
 
 
973 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  46.46 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  48.57 
 
 
180 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  50.52 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  51.61 
 
 
1033 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  43.24 
 
 
137 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.31 
 
 
179 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 
234 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 
234 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 
213 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
227 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  41.58 
 
 
215 aa  78.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  50.55 
 
 
168 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  49.06 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  43.44 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  51.04 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  47.25 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  24.58 
 
 
662 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  22.99 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  42.74 
 
 
143 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  46.28 
 
 
489 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  41.03 
 
 
267 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  55.56 
 
 
255 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  39.5 
 
 
366 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
263 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  24.77 
 
 
660 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 
266 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 
182 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
576 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.17 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.12 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.12 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  42.98 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.9 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 
167 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  49.49 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.86 
 
 
214 aa  75.1  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  43.88 
 
 
108 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0814566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  49.49 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  43.88 
 
 
108 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  40.34 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  44.25 
 
 
122 aa  74.7  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  46.53 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
174 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.87 
 
 
256 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.76 
 
 
745 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  48.86 
 
 
567 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
441 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  49.48 
 
 
343 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  49.48 
 
 
343 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  39.5 
 
 
350 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 
165 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.15 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  44.66 
 
 
245 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
267 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  38.83 
 
 
142 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 
225 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
256 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  49.48 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 
521 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 
175 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  47.92 
 
 
493 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  45.65 
 
 
204 aa  72  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 
223 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  47.31 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  49.44 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  44.55 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  45.19 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  47.31 
 
 
903 aa  71.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  42.48 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  40.34 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  47.52 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>