More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0250 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.84 
 
 		 1033 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 517 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  43.09 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.38 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  36.3 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  36.3 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  36.94 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.31 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.46 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  37.65 
 
 		 1901 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  41.91 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 222 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.14 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  49.5 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.01 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 		 263 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  42.48 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.44 
 
 		 320 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  38.13 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  44.17 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.87 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 567 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 441 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  48.24 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  41.9 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  54.22 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  37.07 
 
 		 885 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  51.02 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.84 
 
 		 576 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 333 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 294 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 		 256 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  48.89 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.06 
 
 		 446 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  40.48 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  43.09 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  52.33 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 681 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 401 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  37.67 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  46.24 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 401 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  42.39 
 
 		 862 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  48.91 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.98 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 432 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 		 408 aa  64.7  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 		 521 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  45.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  34.93 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.61 
 
 		 381 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 		 285 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  54.55 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  49.45 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 336 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 336 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 		 540 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  46.67 
 
 		 526 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>