More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2150 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  31.73 
 
 
362 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 
354 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
365 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  30.93 
 
 
489 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  36.49 
 
 
361 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  27.51 
 
 
365 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
416 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.93 
 
 
493 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  24.58 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  37 
 
 
418 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  36.46 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  32.13 
 
 
381 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  33.56 
 
 
411 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  43.51 
 
 
973 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.6 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 
1033 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.73 
 
 
446 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.54 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  39.52 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.64 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.02 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  46.22 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.83 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.1 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.71 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  52.17 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.52 
 
 
526 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  52.17 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.57 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  38.93 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.27 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  47.66 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  41.74 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.32 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  43.97 
 
 
243 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
524 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  45.38 
 
 
184 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  46.36 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
1191 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 
903 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.76 
 
 
745 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 
776 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  44.04 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.28 
 
 
734 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  44.04 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
567 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  39.83 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 
175 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  42.73 
 
 
900 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 
213 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.83 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  45.36 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  49.45 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
182 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40.57 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 
225 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  45.36 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  42.06 
 
 
234 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  50.63 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  43.59 
 
 
391 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  43.55 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>