More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5019 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  61.86 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  58.92 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  48.03 
 
 		 411 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  52.12 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  62.68 
 
 		 433 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  45.04 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  47.52 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  30.7 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  31.61 
 
 		 362 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  33.05 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  54.65 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  22.18 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  54.76 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  51.09 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  46.15 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  53.01 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  30 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  47.12 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 447 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  42.52 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  48.84 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 1033 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  39.29 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  46.34 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 		 973 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  44.94 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 		 163 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  45.19 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  41.89 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.23 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  48.84 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  36.13 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  47.44 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3010  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 60 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  45.98 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.26 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.72 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 		 122 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 182 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  41.25 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 483 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.82 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  44.87 
 
 		 824 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.57 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  34.19 
 
 		 537 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  48.39 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  45.57 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  42.05 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1191 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  48.86 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  48.39 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  49.33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.94 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  43.42 
 
 		 533 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  33.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  49.44 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.71 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  33.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.27 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>