More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0316 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 384 aa  789    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.28 
 
 		 900 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  44.34 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  47.45 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  48.2 
 
 		 225 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  40.36 
 
 		 174 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.33 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.98 
 
 		 286 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.43 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.62 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.45 
 
 		 234 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 903 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.67 
 
 		 182 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.84 
 
 		 745 aa  94.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 		 567 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 		 277 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 291 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  45.83 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.53 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  36.92 
 
 		 734 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.79 
 
 		 1033 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  44.24 
 
 		 216 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  46.51 
 
 		 340 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  46.77 
 
 		 182 aa  90.1  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.41 
 
 		 309 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 517 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.81 
 
 		 213 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  39.1 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 		 521 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.72 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 		 219 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  45.76 
 
 		 180 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.04 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.45 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  41.45 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  41.45 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  38.83 
 
 		 266 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.76 
 
 		 214 aa  86.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  42.07 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  41.61 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  43.97 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  36.21 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  38.42 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  42.17 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 776 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.28 
 
 		 525 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  48.78 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.27 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  38.78 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.61 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 		 215 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  39.53 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  41.91 
 
 		 189 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  41.72 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  41.72 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  47.26 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.91 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  37.65 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.72 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  33.92 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  33.92 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.39 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.39 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  36.46 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.8 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  43.7 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.8 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.06 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  37.58 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  37.35 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.98 
 
 		 1191 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>