More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6262 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 408 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  48.05 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  51.09 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  45.37 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  45.91 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  46.71 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  48.37 
 
 		 298 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  37.74 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.15 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 489 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  37.64 
 
 		 241 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  34.5 
 
 		 233 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  32.95 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.08 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 237 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  28 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  30.62 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.67 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 844 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 		 710 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.93 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.69 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.97 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.13 
 
 		 734 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.46 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 567 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  34.84 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 825 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  34.64 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  33.55 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  34.9 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.46 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  35.65 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  35.65 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.17 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  31.1 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 521 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  24.52 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  33.58 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.17 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  31.58 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.92 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  30.3 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  25.62 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.56 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  30.81 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>