More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2559 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  53.64 
 
 
162 aa  154  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 
312 aa  97.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  31.13 
 
 
222 aa  84  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40.29 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40.29 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  40.3 
 
 
418 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.35 
 
 
416 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  33.92 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  36.91 
 
 
264 aa  74.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
452 aa  74.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
433 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.66 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  48.86 
 
 
456 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.16 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  37.6 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 
540 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.68 
 
 
521 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  43 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
1033 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  41.07 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  34.84 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  34.76 
 
 
903 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.07 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  38.4 
 
 
900 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  45.05 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.94 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.17 
 
 
517 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  36.77 
 
 
411 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 
401 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 
401 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.14 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 
259 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.24 
 
 
309 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.34 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  34.29 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.24 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.15 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  41.03 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 
447 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  33.75 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  42 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 
432 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  37.34 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.82 
 
 
446 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.32 
 
 
332 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.86 
 
 
441 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
567 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  42.99 
 
 
412 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
340 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
493 aa  63.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 
408 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 
576 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  29.52 
 
 
279 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  43.53 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.99 
 
 
216 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 
710 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.29 
 
 
386 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
273 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  38.68 
 
 
273 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  38.79 
 
 
219 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  41.23 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  38.68 
 
 
273 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.71 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  33.1 
 
 
440 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 
250 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 
288 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  34.88 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  36.24 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 
514 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
273 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  40.86 
 
 
325 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  38.68 
 
 
273 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.44 
 
 
343 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.44 
 
 
343 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  34.06 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  33.59 
 
 
255 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 
238 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 
320 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  40.57 
 
 
453 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>