More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1375 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 514 aa  1066    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  63.98 
 
 		 497 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  45.52 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  34.51 
 
 		 227 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  47.45 
 
 		 197 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  44.44 
 
 		 165 aa  97.8  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  35.64 
 
 		 218 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  42.15 
 
 		 170 aa  97.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  34.29 
 
 		 187 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  38.67 
 
 		 159 aa  91.3  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.33 
 
 		 538 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  50.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  33.95 
 
 		 191 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  37.5 
 
 		 610 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  32.79 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  57.35 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.27 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  45.45 
 
 		 745 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  45.26 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.98 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  59.09 
 
 		 903 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 184 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  40.17 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  58.57 
 
 		 208 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  36.31 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  47.73 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  36.31 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  31.82 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  47.37 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 		 567 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  48.35 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  48.78 
 
 		 146 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  47.96 
 
 		 225 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.4 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.62 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 521 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  46.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.68 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  47.19 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  45.78 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  38.66 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.32 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.26 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 152 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 949 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  39.8 
 
 		 147 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  43.01 
 
 		 332 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.57 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 		 143 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  50.65 
 
 		 149 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  46.34 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  50.65 
 
 		 149 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  40.17 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  48.78 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  44 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  44.32 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1033 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  38.35 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  29.06 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  39.77 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  43.69 
 
 		 293 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.56 
 
 		 277 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  41.75 
 
 		 973 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  43.16 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  43.01 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 		 172 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 		 204 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  28.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  28.71 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  43.01 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 130 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  28.57 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40.52 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>