More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1326 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  63.98 
 
 
514 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
497 aa  1027    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  47.48 
 
 
177 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  35.35 
 
 
218 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  46.22 
 
 
170 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  43.31 
 
 
164 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  47.5 
 
 
227 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  44.44 
 
 
197 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  34.1 
 
 
187 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  38.12 
 
 
610 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  38.51 
 
 
159 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.77 
 
 
538 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  60 
 
 
208 aa  86.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  32.42 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  33.75 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  32.53 
 
 
158 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  56.34 
 
 
190 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  32.26 
 
 
158 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  31.49 
 
 
199 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.19 
 
 
184 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  38.18 
 
 
152 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  44.34 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.03 
 
 
745 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.94 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
900 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.41 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  31.18 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  35.14 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  41.3 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  40.59 
 
 
142 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 
145 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.35 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 
145 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 
204 aa  67  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.58 
 
 
1033 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  31.93 
 
 
168 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.12 
 
 
216 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 
149 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  51.35 
 
 
276 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
245 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  39.45 
 
 
179 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  39.22 
 
 
600 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 
149 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 
165 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
213 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  41.05 
 
 
143 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  28.74 
 
 
191 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  42.53 
 
 
172 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.76 
 
 
447 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.23 
 
 
320 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.88 
 
 
234 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 
145 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  42.22 
 
 
189 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 
327 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  41.33 
 
 
156 aa  63.9  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  41.77 
 
 
614 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.61 
 
 
319 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
903 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  48.53 
 
 
382 aa  63.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  49.3 
 
 
340 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.45 
 
 
521 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 
206 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 
206 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
576 aa  63.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 
263 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
973 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
489 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
183 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 
214 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
183 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
183 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.02 
 
 
174 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 
122 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 
293 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 
168 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
278 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
292 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
237 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  39.76 
 
 
151 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  40.23 
 
 
102 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  36.15 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  32.54 
 
 
245 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
184 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>