More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0475 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  34.56 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  36.84 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.24 
 
 		 286 aa  92  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.58 
 
 		 343 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.58 
 
 		 343 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 259 aa  88.6  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  33.88 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 		 903 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.15 
 
 		 1033 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  47.86 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  53.68 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  34.46 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.99 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  42.54 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.43 
 
 		 525 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.22 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.12 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40.97 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 567 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  46.46 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  49.46 
 
 		 256 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.39 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  47.31 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.18 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.86 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.1 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.1 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  36.42 
 
 		 412 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  46.9 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 		 866 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  46.23 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.69 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.46 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  40.15 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.22 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  51.72 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.23 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  44.53 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 949 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  37.6 
 
 		 734 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.71 
 
 		 576 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 489 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  35.17 
 
 		 350 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 333 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 824 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 973 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  35.97 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 384 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.19 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  36.16 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.52 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  36.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  48.98 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 521 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 		 862 aa  68.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  27.63 
 
 		 961 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.18 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  36.03 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  33.95 
 
 		 825 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.52 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  51.85 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  34.21 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>