More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3546 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  54.19 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.56 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.74 
 
 		 745 aa  85.5  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  52.29 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  53.21 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  45.16 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  49.02 
 
 		 1033 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  41.61 
 
 		 776 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  52.43 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.91 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  49.11 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.41 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.13 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.13 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  52.04 
 
 		 489 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  39.67 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  46.36 
 
 		 973 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  43.08 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 		 175 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  36.81 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  48.6 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.27 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  44.92 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  44.92 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.72 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.42 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  46.49 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.64 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  37.59 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.62 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  35.92 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  46.9 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  38.84 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  41.07 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  45.61 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  47.32 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  41.07 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  42.96 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.61 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.06 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.55 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  50.49 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  51.72 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.12 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  51.11 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  45.74 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  51.4 
 
 		 184 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  47.57 
 
 		 194 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  32.78 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 		 903 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  57.69 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  48.67 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  57.69 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  49.53 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  42.02 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  47.52 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  52.17 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  44.62 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  49.53 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.22 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  48.94 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  41.07 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  50.98 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 		 450 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  40.58 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  45.95 
 
 		 1831 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.35 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  45.79 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  44.53 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  41.82 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  41.22 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  42.97 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  39.84 
 
 		 1191 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>