More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5268 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
180 aa  360  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  59.09 
 
 
176 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  59.09 
 
 
176 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  48.89 
 
 
182 aa  147  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  47.83 
 
 
182 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  48.23 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.81 
 
 
286 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.61 
 
 
309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 
267 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  51.18 
 
 
381 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  45.03 
 
 
189 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
449 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 
184 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  46.72 
 
 
263 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  47.24 
 
 
225 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  43.15 
 
 
234 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  43.15 
 
 
234 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.98 
 
 
184 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  46.48 
 
 
194 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  46.04 
 
 
234 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.59 
 
 
320 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 
517 aa  98.2  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  47.18 
 
 
260 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
386 aa  98.2  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  46.26 
 
 
336 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  46.26 
 
 
336 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 
567 aa  97.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.67 
 
 
340 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  47.1 
 
 
351 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.48 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  47.33 
 
 
214 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  46.83 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  44.97 
 
 
441 aa  95.9  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 
291 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 
291 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  41.82 
 
 
294 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 
343 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 
343 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.45 
 
 
227 aa  94.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
309 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.18 
 
 
521 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  46.76 
 
 
311 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
1033 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 
411 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  44.27 
 
 
446 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 
264 aa  92  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  42.64 
 
 
225 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.93 
 
 
225 aa  91.3  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.56 
 
 
332 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  48.33 
 
 
900 aa  91.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  39.1 
 
 
903 aa  91.3  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  42.03 
 
 
315 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  43.92 
 
 
294 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.88 
 
 
489 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  43.07 
 
 
319 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  50.43 
 
 
268 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
440 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 
315 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 
442 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
333 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  46.72 
 
 
447 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  32.04 
 
 
231 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.89 
 
 
493 aa  88.2  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
448 aa  87.8  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  46.56 
 
 
381 aa  87.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 
273 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  43.1 
 
 
393 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  49.19 
 
 
216 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  45.76 
 
 
384 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 
195 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  44.53 
 
 
408 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.34 
 
 
277 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  39.24 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  38.24 
 
 
362 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 
250 aa  85.5  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.89 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  34.9 
 
 
267 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
254 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
254 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.58 
 
 
727 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 
973 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.83 
 
 
745 aa  84.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  43.61 
 
 
493 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 
223 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  45.8 
 
 
576 aa  84.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  50.91 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  43.36 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  45.04 
 
 
260 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  44.03 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.72 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  35.06 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.38 
 
 
537 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.79 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  45.11 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  44.03 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>