More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4964 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
250 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  51.4 
 
 
240 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 
493 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.85 
 
 
489 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  38.57 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
365 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  37.32 
 
 
418 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  32.59 
 
 
411 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 
343 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 
343 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 
576 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 
361 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 
1033 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  50.44 
 
 
517 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
433 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
900 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 
277 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  45.97 
 
 
194 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  52.21 
 
 
245 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 
231 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  35.92 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.12 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.12 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.72 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  45.67 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  48.7 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  46.97 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.17 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  51.28 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  45.76 
 
 
745 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  49.12 
 
 
381 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.55 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.96 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 
368 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  56.04 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  47.75 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  49.02 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  53.93 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  52.58 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.25 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  52.58 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  56.52 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 
351 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  55.17 
 
 
331 aa  79  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 
320 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  48.21 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  47.54 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  42.36 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.77 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
903 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.49 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  45.83 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  46.9 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  44.88 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  47.86 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  46.67 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  51.89 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  50.96 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  46.67 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  41.46 
 
 
1191 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  50.52 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  48.18 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  46.61 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  45.38 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  48.57 
 
 
521 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  47.52 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  39.37 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  45.63 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  51.72 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  52.08 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  45.24 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  48.62 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  45.93 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  45.93 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  44.17 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  49 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 
727 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  52.7 
 
 
393 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  51.52 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  45.13 
 
 
493 aa  72  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>