More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2974 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  100 
 
 		 366 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  90.71 
 
 		 366 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  92.86 
 
 		 350 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  96.17 
 
 		 366 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  96.45 
 
 		 366 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  33.96 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  33.21 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  33.21 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  33.21 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1047  secreted effector protein  33.33 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.18 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.97 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.03 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.88 
 
 		 567 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.3 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.6 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 776 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  35.6 
 
 		 493 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.62 
 
 		 286 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.96 
 
 		 225 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.42 
 
 		 745 aa  99.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 267 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 		 1033 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  34.5 
 
 		 259 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 521 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.29 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  34.63 
 
 		 517 aa  92.8  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.13 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.8 
 
 		 241 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.42 
 
 		 525 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.8 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 		 278 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.05 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  35.6 
 
 		 216 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 		 264 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.28 
 
 		 870 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.16 
 
 		 862 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.18 
 
 		 214 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 		 1191 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 213 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.43 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 273 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 184 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.2 
 
 		 515 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  36 
 
 		 222 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  36 
 
 		 222 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.58 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.15 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.16 
 
 		 903 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.51 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.6 
 
 		 734 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  39.44 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 872 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  35.23 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.91 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 727 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 213 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 		 189 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 		 175 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>