More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3191 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
903 aa  1840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.61 
 
 
245 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.24 
 
 
1033 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.07 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.64 
 
 
900 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  50.67 
 
 
745 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  46.75 
 
 
521 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 
291 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.18 
 
 
381 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.79 
 
 
517 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  40.24 
 
 
734 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 
291 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 
567 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  42.28 
 
 
294 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.37 
 
 
234 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  46.91 
 
 
416 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
214 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 
351 aa  104  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.35 
 
 
493 aa  103  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.93 
 
 
489 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.45 
 
 
449 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 
386 aa  101  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.01 
 
 
320 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50.72 
 
 
277 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
184 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
234 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.78 
 
 
225 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
234 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.15 
 
 
225 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 
219 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.59 
 
 
776 aa  99  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.9 
 
 
309 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  41.42 
 
 
710 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.99 
 
 
332 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.02 
 
 
184 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 
264 aa  97.4  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  45.25 
 
 
278 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.62 
 
 
213 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.3 
 
 
286 aa  95.9  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
213 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  44.1 
 
 
343 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 
219 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 
384 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  44.1 
 
 
343 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 
266 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
279 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 
189 aa  95.1  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
279 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 
174 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  43.6 
 
 
447 aa  94.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 
340 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 
363 aa  94  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 
227 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.11 
 
 
311 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.8 
 
 
268 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34.68 
 
 
448 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.84 
 
 
333 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  43.55 
 
 
295 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 
319 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.24 
 
 
441 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  42.29 
 
 
219 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  45.08 
 
 
182 aa  91.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  42.14 
 
 
267 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 
263 aa  91.3  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 
160 aa  91.3  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  42.29 
 
 
219 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.1 
 
 
180 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 
515 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.04 
 
 
300 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.83 
 
 
254 aa  90.1  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 
219 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 
450 aa  90.1  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  38.04 
 
 
217 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.3 
 
 
259 aa  90.1  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  42.48 
 
 
433 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 
260 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 
285 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 
256 aa  88.6  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 
576 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.58 
 
 
706 aa  87.8  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 
199 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 
299 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
412 aa  87.8  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 
727 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 
199 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
524 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  42.75 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  37.64 
 
 
204 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  41.29 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  38.85 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
862 aa  85.5  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>