More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0809 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 
180 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  44.51 
 
 
343 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  44.51 
 
 
343 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
182 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 
184 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.69 
 
 
263 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.43 
 
 
449 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 
194 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
234 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
234 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  40.41 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.04 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 
320 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  39.44 
 
 
187 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 
332 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.55 
 
 
176 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.62 
 
 
517 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  41.55 
 
 
176 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  45.8 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  41.29 
 
 
223 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  49.6 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 
189 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 
184 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.74 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
567 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 
195 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
294 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  46.9 
 
 
168 aa  88.6  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 
576 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.43 
 
 
179 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  40.29 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
521 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 
448 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 
446 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  38.31 
 
 
381 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  46.36 
 
 
489 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
351 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.16 
 
 
386 aa  85.5  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
524 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.96 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.92 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 
167 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  38.69 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  48.21 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.22 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.12 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  38.97 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  52.75 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  52.75 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.61 
 
 
1033 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.7 
 
 
900 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
165 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.83 
 
 
745 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  38.56 
 
 
195 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  45.71 
 
 
168 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  46.46 
 
 
903 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  44.55 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 
143 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  44.25 
 
 
973 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  49.02 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  43.36 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  35.66 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  46.3 
 
 
115 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
862 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.5 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  42.74 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  36.03 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.6 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40.32 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.05 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  38.16 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  40.5 
 
 
450 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 
453 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.93 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  42.64 
 
 
199 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  39.1 
 
 
734 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  32.51 
 
 
233 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  32.51 
 
 
233 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  48.96 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 
199 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  40.16 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>