More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3095 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  41.7 
 
 
262 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  41.7 
 
 
262 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 
268 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.93 
 
 
264 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  43.39 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.19 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.52 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
279 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  44.32 
 
 
225 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
279 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.22 
 
 
286 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 
309 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  42.37 
 
 
333 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  39.08 
 
 
195 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 
343 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 
343 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 
267 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
351 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44 
 
 
449 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 
576 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.45 
 
 
356 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
295 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.7 
 
 
493 aa  98.6  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 
489 aa  97.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
356 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.72 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  36.61 
 
 
441 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.4 
 
 
517 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 
320 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.39 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.67 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.81 
 
 
332 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 
357 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.37 
 
 
1033 aa  95.9  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 
446 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.14 
 
 
386 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 
319 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 
521 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.14 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 
432 aa  92  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
182 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 
336 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 
336 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  32.7 
 
 
300 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.41 
 
 
412 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  36.82 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  48.91 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 
241 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 
291 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 
291 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.12 
 
 
277 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 
416 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.42 
 
 
340 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 
447 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
381 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
448 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.78 
 
 
294 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
420 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.14 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.16 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.14 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  29.61 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 
567 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.5 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 
263 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.8 
 
 
734 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  40.27 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 
450 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.23 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 
433 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  36.72 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  31.72 
 
 
447 aa  81.3  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  38.75 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  36.99 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
862 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  35.4 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  35.4 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  38.61 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36.53 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  33.69 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  36.84 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  35.52 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  40.58 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 
525 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  40.94 
 
 
165 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>