More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0246 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  44.92 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 
279 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 
279 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 
356 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  40.19 
 
 
210 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  36.51 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 
357 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.49 
 
 
268 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.1 
 
 
441 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 
432 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.6 
 
 
295 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.93 
 
 
309 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  42.46 
 
 
264 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 
416 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.71 
 
 
449 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.21 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  42.41 
 
 
440 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.97 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.01 
 
 
300 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 
446 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 
351 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.25 
 
 
381 aa  95.5  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 
408 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.37 
 
 
576 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.66 
 
 
343 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.66 
 
 
343 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.14 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.83 
 
 
567 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 
420 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 
412 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 
447 aa  92  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.94 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.36 
 
 
182 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 
521 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.56 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.95 
 
 
706 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 
340 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  44.17 
 
 
333 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 
189 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  48.7 
 
 
418 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 
903 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.71 
 
 
450 aa  89  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 
515 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
1033 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  42.07 
 
 
194 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.04 
 
 
517 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 
493 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.92 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  37.44 
 
 
234 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 
219 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  38.46 
 
 
734 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.1 
 
 
319 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.45 
 
 
489 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  35.18 
 
 
381 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.69 
 
 
389 aa  85.9  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
225 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  36.75 
 
 
710 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  37.16 
 
 
412 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.53 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.89 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  36.52 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  45.04 
 
 
180 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  40.61 
 
 
401 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  40.61 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 
862 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  42.45 
 
 
493 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  35.4 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.33 
 
 
452 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.26 
 
 
259 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 
199 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.03 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.84 
 
 
727 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  42.98 
 
 
123 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  46.49 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>