More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0521 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  36.51 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 
357 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  39.11 
 
 
218 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.22 
 
 
268 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 
210 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 
243 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 
279 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 
279 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 
264 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 
262 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 
262 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.2 
 
 
300 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  35.57 
 
 
391 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.24 
 
 
449 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  36.14 
 
 
432 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  34.08 
 
 
356 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 
309 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.79 
 
 
1033 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.15 
 
 
285 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
295 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  33.52 
 
 
356 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.43 
 
 
517 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  38.3 
 
 
381 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.51 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.86 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.41 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.56 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  32.78 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 
973 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.71 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.71 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  40.13 
 
 
389 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
441 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.14 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.72 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 
420 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  39.19 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.7 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.67 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 
450 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
489 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  39.1 
 
 
319 aa  74.7  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.29 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.43 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.91 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.14 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  36 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.93 
 
 
745 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 
336 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 
336 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 
576 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
567 aa  71.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.97 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  42.74 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.41 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  43.44 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  33.11 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.88 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.24 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  36.15 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  36.15 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.41 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 
862 aa  68.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  41.54 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.7 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  45.88 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  32.28 
 
 
442 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.54 
 
 
401 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>