More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1201 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1043    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  42.81 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  40.42 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.63 
 
 		 381 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  35.57 
 
 		 285 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 		 309 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  35.69 
 
 		 872 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.26 
 
 		 264 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.74 
 
 		 351 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.02 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 862 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.01 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 319 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  33.21 
 
 		 600 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.52 
 
 		 295 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 262 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 		 1191 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.24 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  32.13 
 
 		 262 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 		 489 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 		 311 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.39 
 
 		 286 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.2 
 
 		 493 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 320 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.44 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.44 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.27 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.79 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.27 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.27 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.79 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.86 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 		 870 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.56 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.4 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 		 294 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 		 567 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.47 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 		 408 aa  101  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 340 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  34.15 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 		 386 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 218 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.02 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 		 844 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 		 241 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 267 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.99 
 
 		 216 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 356 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  37.26 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 356 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.7 
 
 		 225 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.42 
 
 		 234 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  32.21 
 
 		 880 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32.21 
 
 		 880 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 442 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 291 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 259 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 291 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.9 
 
 		 846 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 349 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.21 
 
 		 949 aa  94.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 348 aa  94.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 		 278 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 		 184 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  31 
 
 		 872 aa  93.6  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  33.84 
 
 		 877 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 219 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 		 727 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  39.52 
 
 		 225 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 		 433 aa  93.2  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 880 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 880 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.62 
 
 		 277 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 880 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  30.89 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.07 
 
 		 214 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.92 
 
 		 1033 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.81 
 
 		 525 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.45 
 
 		 14916 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 		 231 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  28.75 
 
 		 389 aa  91.3  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 		 227 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 363 aa  90.9  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 446 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 		 903 aa  90.5  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  36.15 
 
 		 233 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  34.95 
 
 		 745 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>