137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4656 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
357 aa  742    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  40.42 
 
 
515 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  38.25 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.22 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 
123 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25.3 
 
 
600 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  32.84 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  32.09 
 
 
242 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  23.46 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 
447 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  30.6 
 
 
130 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  21.76 
 
 
206 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  23.04 
 
 
218 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
441 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  23.57 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.45 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  23.81 
 
 
961 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  23.18 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 
206 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  35.4 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 
264 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 
521 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 
279 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 
279 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  22.67 
 
 
262 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 
230 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  31.46 
 
 
218 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  25.17 
 
 
183 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.06 
 
 
197 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  23.73 
 
 
262 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
420 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  20.53 
 
 
412 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 
866 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  23.5 
 
 
450 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
567 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 
862 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  31.58 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
452 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  29.03 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  30 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  21.39 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.08 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  20.89 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.07 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  23.84 
 
 
846 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  27.48 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  23.48 
 
 
174 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 
872 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.41 
 
 
205 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.75 
 
 
206 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  21.6 
 
 
745 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.37 
 
 
949 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 
408 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 
727 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  20.89 
 
 
356 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 
186 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  22.48 
 
 
872 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  23.14 
 
 
903 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
497 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.15 
 
 
976 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  22.93 
 
 
218 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  24.43 
 
 
300 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  25.37 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  27.5 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
1831 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  24.53 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  27.15 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  32.86 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  20.81 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  20.81 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  23.31 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  23.42 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  21.49 
 
 
881 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 
710 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  23.31 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  23.31 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
214 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10740  uncharacterized low-complexity protein  30.71 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.678168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  21.2 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  25.4 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 
442 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  28.7 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 
203 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  24.53 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.83 
 
 
844 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>