More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4733 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  90.07 
 
 		 453 aa  743    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  90.29 
 
 		 485 aa  766    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 452 aa  879    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  65.77 
 
 		 456 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  69.47 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.91 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 		 309 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.36 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.46 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  34.22 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.28 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 386 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 		 862 aa  103  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  39.34 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.24 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 		 576 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.92 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.49 
 
 		 291 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.53 
 
 		 521 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.49 
 
 		 291 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.21 
 
 		 225 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.35 
 
 		 336 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.35 
 
 		 336 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.23 
 
 		 264 aa  96.3  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.53 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 214 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 		 268 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.91 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 493 aa  94.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.04 
 
 		 267 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.91 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.62 
 
 		 734 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  38.29 
 
 		 870 aa  93.2  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.83 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 216 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 567 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.31 
 
 		 776 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 		 213 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.3 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.32 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.3 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.5 
 
 		 745 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 294 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 440 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.32 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 		 319 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 727 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.3 
 
 		 266 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 949 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.68 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 		 241 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.34 
 
 		 14916 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 		 277 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1191 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 215 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.93 
 
 		 174 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  34.8 
 
 		 259 aa  87  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 		 204 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  32.17 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  36.87 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.02 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  34.52 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  35.06 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.95 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 		 844 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.07 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  33.84 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  34.26 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.02 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.8 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  36.16 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.49 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.24 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  23.88 
 
 		 601 aa  82.8  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  42.62 
 
 		 176 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 		 184 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  42.62 
 
 		 176 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.2 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  40.49 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  35.33 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>