More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0087 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1237    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  33.47 
 
 		 391 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 		 449 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.21 
 
 		 515 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.46 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 521 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 		 312 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.3 
 
 		 320 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.05 
 
 		 234 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 517 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.3 
 
 		 286 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.19 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 268 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.47 
 
 		 336 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.47 
 
 		 336 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.19 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 356 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.96 
 
 		 734 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  30.04 
 
 		 262 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  30.83 
 
 		 262 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.1 
 
 		 225 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 		 351 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 1191 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.14 
 
 		 1033 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.54 
 
 		 776 aa  98.2  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 727 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 332 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 		 311 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 263 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 300 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 		 386 aa  95.1  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.08 
 
 		 880 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 		 710 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 877 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 		 493 aa  93.6  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 		 213 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 880 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 340 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 250 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 184 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 		 214 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 		 204 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.7 
 
 		 343 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.7 
 
 		 343 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 285 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 		 319 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  30.34 
 
 		 745 aa  91.3  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.2 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 333 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 		 182 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 		 278 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 218 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.1 
 
 		 266 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 294 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.87 
 
 		 441 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 216 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 440 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.01 
 
 		 218 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.8 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.17 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 872 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.94 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.88 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  30.7 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.88 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.41 
 
 		 14916 aa  83.6  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 		 231 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  33.18 
 
 		 267 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  30.29 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 		 870 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  30.08 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  32.88 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  29.71 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.74 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  36 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.74 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.87 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42.06 
 
 		 180 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.88 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>