More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3552 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 415 aa  811    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  68.98 
 
 		 452 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  66.5 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  67 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  67.99 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.62 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.39 
 
 		 268 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.19 
 
 		 214 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.84 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  33 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  33 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.68 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.89 
 
 		 286 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.07 
 
 		 576 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 		 267 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  32.51 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.24 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.6 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.18 
 
 		 521 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.04 
 
 		 213 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 264 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.75 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.68 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  32.51 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.5 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.18 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.15 
 
 		 250 aa  87.8  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.69 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.6 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  34.51 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.55 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.55 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 		 657 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1191 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.45 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.63 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.02 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.05 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.48 
 
 		 862 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.95 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 		 776 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  38.02 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.13 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.13 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 		 241 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.64 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.68 
 
 		 1033 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  26.64 
 
 		 727 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 		 872 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.24 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.59 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.78 
 
 		 745 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.41 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  39.18 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.75 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.16 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 309 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 		 844 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.52 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>