More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0024 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 949 aa  1969    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  34.24 
 
 		 976 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 870 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  26.71 
 
 		 886 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.19 
 
 		 844 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  24.63 
 
 		 881 aa  224  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  32.65 
 
 		 846 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  30.96 
 
 		 866 aa  180  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 862 aa  154  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 825 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.11 
 
 		 872 aa  129  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.9 
 
 		 449 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.66 
 
 		 381 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 351 aa  121  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29 
 
 		 332 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 872 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 359 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 389 aa  112  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 877 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 348 aa  112  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 880 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 576 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  26.28 
 
 		 880 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 880 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 880 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 880 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 309 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.2 
 
 		 489 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  32.34 
 
 		 267 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.22 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 320 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 		 336 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 		 336 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 285 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 343 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 343 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.96 
 
 		 311 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 268 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 319 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 		 333 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1191 aa  97.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 		 340 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.37 
 
 		 264 aa  96.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.8 
 
 		 349 aa  94.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 		 300 aa  94.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.38 
 
 		 286 aa  94.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.21 
 
 		 515 aa  94.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 		 295 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 493 aa  93.2  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 862 aa  93.2  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 		 354 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.94 
 
 		 448 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 354 aa  92  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 440 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  29.84 
 
 		 416 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 493 aa  90.5  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  30.29 
 
 		 370 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 420 aa  90.5  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  26.07 
 
 		 343 aa  90.9  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 		 452 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.06 
 
 		 734 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 356 aa  89.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 452 aa  88.6  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 		 294 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 		 227 aa  87.8  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 483 aa  87.8  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 		 354 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  25.72 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 		 214 aa  87  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  26.49 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  24.2 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  24.2 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  24.2 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.39 
 
 		 291 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 262 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 363 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  30.05 
 
 		 370 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.28 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  24.2 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.69 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  23.89 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.7 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  28.37 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 291 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 213 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>