More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0029 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 976 aa  2018    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  34.24 
 
 		 949 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 870 aa  255  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 844 aa  227  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 		 866 aa  215  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  23.71 
 
 		 886 aa  201  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.46 
 
 		 862 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  22.23 
 
 		 825 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 825 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 872 aa  158  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  28.27 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.38 
 
 		 846 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.54 
 
 		 359 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.6 
 
 		 449 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 360 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  92.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.01 
 
 		 576 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  92.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  92.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  20.98 
 
 		 872 aa  91.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 360 aa  91.3  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  21.97 
 
 		 877 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.3 
 
 		 309 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 360 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.57 
 
 		 381 aa  89.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 354 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  28.27 
 
 		 370 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 354 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  24.48 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.14 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  30.81 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  23.03 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  24.93 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  27.5 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.38 
 
 		 336 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.38 
 
 		 336 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.85 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  25.78 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  25.78 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  25.78 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  25.78 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.03 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.42 
 
 		 355 aa  80.9  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  30.65 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 		 343 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 264 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  24.25 
 
 		 354 aa  77  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 		 343 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 		 370 aa  77.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 		 485 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  23.93 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 294 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  20.97 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 862 aa  75.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.25 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  28.21 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  23.59 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.93 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1191 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  23.94 
 
 		 309 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23.8 
 
 		 448 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  30.85 
 
 		 203 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  27.31 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 312 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  30.88 
 
 		 262 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 363 aa  73.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.71 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  29.19 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  27.13 
 
 		 343 aa  72  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  25.7 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  28.73 
 
 		 356 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 285 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  25.77 
 
 		 399 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 242 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 241 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>