More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  100 
 
 
343 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  38.25 
 
 
358 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
349 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 
356 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 
370 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 
356 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 
360 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  33.72 
 
 
360 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  33.72 
 
 
360 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  33.72 
 
 
360 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  34.69 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.38 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.1 
 
 
359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  29.49 
 
 
846 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
354 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
844 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 
449 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
354 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.2 
 
 
309 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 
576 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
862 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.36 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.45 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.45 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.45 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.45 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 
862 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
825 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  30.45 
 
 
825 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 
949 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
870 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.43 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  30.64 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  21.15 
 
 
601 aa  88.6  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 
872 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 
521 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.64 
 
 
880 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.87 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
877 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.93 
 
 
607 aa  87.4  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
880 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
880 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
880 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.91 
 
 
880 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 
517 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.7 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.05 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.82 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  29.35 
 
 
734 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 
866 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 
727 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 
872 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.93 
 
 
976 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  29.74 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 
452 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.67 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.02 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.32 
 
 
600 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.93 
 
 
295 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.49 
 
 
14916 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 
203 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  27.57 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  24.21 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.88 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  21.91 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  21.91 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.28 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 
706 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 
184 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  28.23 
 
 
227 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.28 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  27.07 
 
 
886 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  20.75 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.89 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.89 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  22.1 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.511853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>