More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0861 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
354 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  84.18 
 
 
354 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  83.9 
 
 
354 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  84.18 
 
 
354 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  84.18 
 
 
354 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  84.18 
 
 
354 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  84.18 
 
 
354 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.78 
 
 
348 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  30.75 
 
 
358 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.11 
 
 
370 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
449 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 
448 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.25 
 
 
381 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  35.46 
 
 
872 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 
862 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.58 
 
 
309 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 
870 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
576 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.18 
 
 
333 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.09 
 
 
356 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
351 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.58 
 
 
359 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.2 
 
 
517 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 
1191 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 
881 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.56 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 
949 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  24.38 
 
 
356 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.15 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.1 
 
 
844 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
862 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.39 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.2 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.28 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.28 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 
727 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.6 
 
 
880 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  37.81 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  29.6 
 
 
880 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  23.05 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  23.05 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 
607 aa  80.9  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 
877 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  29.3 
 
 
866 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.66 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.1 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.25 
 
 
976 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.78 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  30.62 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.17 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.22 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.85 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  31.19 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  27.2 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.11 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  25.51 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>