More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0542 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  99.43 
 
 		 880 aa  1686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  100 
 
 		 880 aa  1695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  99.55 
 
 		 880 aa  1688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  98.98 
 
 		 877 aa  1529    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  74.94 
 
 		 872 aa  1137    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  99.43 
 
 		 880 aa  1686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  99.43 
 
 		 880 aa  1686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.89 
 
 		 844 aa  187  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  21.19 
 
 		 976 aa  151  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 		 825 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 825 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 862 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.97 
 
 		 381 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 		 449 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.11 
 
 		 846 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.29 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 		 448 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 601 aa  115  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.44 
 
 		 340 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 		 309 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.12 
 
 		 521 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 949 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 870 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.81 
 
 		 336 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.81 
 
 		 336 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 332 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  29.74 
 
 		 881 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.64 
 
 		 872 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.6 
 
 		 311 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 489 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 866 aa  98.2  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1191 aa  97.8  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 440 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.5 
 
 		 320 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 862 aa  97.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 		 493 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 		 268 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 389 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.08 
 
 		 600 aa  94.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 264 aa  94.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.25 
 
 		 515 aa  94.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 		 517 aa  94.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 447 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 		 635 aa  92.8  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.56 
 
 		 727 aa  93.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 886 aa  93.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 333 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 576 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 		 343 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 		 343 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 825 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 825 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 825 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 825 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.15 
 
 		 401 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.15 
 
 		 401 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.88 
 
 		 493 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.12 
 
 		 319 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.62 
 
 		 483 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  30.62 
 
 		 420 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.46 
 
 		 14916 aa  89.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 		 446 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  88.2  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.62 
 
 		 607 aa  88.2  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 348 aa  88.2  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 		 367 aa  87.8  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 		 367 aa  87.8  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 408 aa  87.4  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34 
 
 		 286 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.95 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 291 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.05 
 
 		 285 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 657 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.16 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.21 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  31.56 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 		 567 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.6 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.03 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.94 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  29.57 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  23.01 
 
 		 401 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  23.01 
 
 		 401 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 		 212 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>