More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2179 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 14916 aa  29110    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  34.63 
 
 		 12741 aa  439  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.56 
 
 		 14829 aa  373  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.88 
 
 		 2812 aa  332  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  28.1 
 
 		 15831 aa  312  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  39.04 
 
 		 2567 aa  298  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.57 
 
 		 4854 aa  293  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.44 
 
 		 5094 aa  272  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 2239 aa  261  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  31.67 
 
 		 2743 aa  251  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  33.53 
 
 		 3758 aa  249  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.15 
 
 		 1883 aa  247  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  33.14 
 
 		 5020 aa  245  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  35.1 
 
 		 2127 aa  219  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  34.72 
 
 		 3439 aa  212  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.76 
 
 		 4285 aa  202  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.8 
 
 		 1141 aa  191  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.29 
 
 		 16311 aa  180  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  35.23 
 
 		 1206 aa  179  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  32.14 
 
 		 2784 aa  178  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  31.94 
 
 		 4661 aa  175  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  37.16 
 
 		 8980 aa  172  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  26.4 
 
 		 15245 aa  168  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.34 
 
 		 2067 aa  166  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  32.01 
 
 		 3229 aa  160  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.3 
 
 		 1553 aa  157  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  32 
 
 		 4465 aa  155  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1191 aa  142  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3391 aa  138  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  40.2 
 
 		 2820 aa  138  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.52 
 
 		 3363 aa  135  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  43.89 
 
 		 2001 aa  134  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  34.69 
 
 		 3132 aa  134  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  41.15 
 
 		 2132 aa  131  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.83 
 
 		 6678 aa  130  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  36.73 
 
 		 8871 aa  127  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 449 aa  126  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  40.11 
 
 		 2133 aa  126  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.95 
 
 		 3182 aa  125  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  27.2 
 
 		 3259 aa  125  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  40.54 
 
 		 2853 aa  122  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 		 862 aa  122  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  26.52 
 
 		 3508 aa  120  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 576 aa  117  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  25.82 
 
 		 3714 aa  117  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  41.48 
 
 		 1838 aa  116  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.43 
 
 		 1599 aa  114  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.81 
 
 		 1855 aa  114  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 		 336 aa  114  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 		 336 aa  114  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 		 4334 aa  111  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  37.84 
 
 		 3089 aa  111  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 493 aa  111  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 		 3954 aa  110  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 872 aa  110  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  39.74 
 
 		 2461 aa  109  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.86 
 
 		 1019 aa  109  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.63 
 
 		 309 aa  109  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.03 
 
 		 381 aa  109  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.68 
 
 		 521 aa  107  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  33.61 
 
 		 2802 aa  107  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.68 
 
 		 36805 aa  106  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.71 
 
 		 3427 aa  106  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  35.84 
 
 		 938 aa  106  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.64 
 
 		 517 aa  105  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.83 
 
 		 333 aa  104  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 332 aa  104  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  39.33 
 
 		 3193 aa  104  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  30.98 
 
 		 337 aa  104  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 		 401 aa  103  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  35.03 
 
 		 940 aa  103  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 		 401 aa  102  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 		 483 aa  101  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 		 389 aa  100  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 412 aa  98.6  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  34.07 
 
 		 3026 aa  96.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.29 
 
 		 489 aa  96.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.56 
 
 		 319 aa  96.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 311 aa  96.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 		 277 aa  95.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.15 
 
 		 824 aa  95.9  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 		 263 aa  94.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.02 
 
 		 440 aa  94  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 		 433 aa  93.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  94.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 343 aa  93.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.55 
 
 		 213 aa  93.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 343 aa  93.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 		 3066 aa  92  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.55 
 
 		 299 aa  91.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  44.8 
 
 		 492 aa  91.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.06 
 
 		 320 aa  91.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.03 
 
 		 870 aa  90.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.45 
 
 		 515 aa  90.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 		 386 aa  90.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.35 
 
 		 184 aa  90.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 880 aa  90.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  32.77 
 
 		 426 aa  90.1  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 880 aa  90.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 294 aa  90.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>