230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1152 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
3363 aa  6586    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.08 
 
 
5745 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.51 
 
 
4978 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.64 
 
 
3927 aa  271  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.17 
 
 
3191 aa  270  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  33.59 
 
 
1269 aa  268  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  36.16 
 
 
1597 aa  258  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  32.64 
 
 
1268 aa  255  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.33 
 
 
1884 aa  244  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.27 
 
 
4848 aa  238  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.94 
 
 
1269 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.46 
 
 
3474 aa  210  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.47 
 
 
1367 aa  190  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.43 
 
 
9867 aa  187  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.08 
 
 
2767 aa  186  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 
2074 aa  185  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 
16322 aa  182  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.52 
 
 
892 aa  179  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.46 
 
 
3477 aa  178  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.28 
 
 
4122 aa  178  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.09 
 
 
1363 aa  176  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.78 
 
 
2839 aa  174  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  34.75 
 
 
721 aa  171  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.13 
 
 
4854 aa  169  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 
2555 aa  168  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 
4220 aa  166  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.88 
 
 
2114 aa  160  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.79 
 
 
850 aa  156  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.26 
 
 
3816 aa  155  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.97 
 
 
2816 aa  155  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 
2507 aa  154  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.11 
 
 
761 aa  154  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  35.24 
 
 
814 aa  153  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  37.44 
 
 
3132 aa  149  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.43 
 
 
1428 aa  148  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  42.08 
 
 
2820 aa  142  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.65 
 
 
2377 aa  139  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 
994 aa  137  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  23.97 
 
 
16311 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.52 
 
 
14916 aa  135  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.09 
 
 
3391 aa  135  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  44 
 
 
2133 aa  132  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  39.08 
 
 
2853 aa  130  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.02 
 
 
4465 aa  128  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
8980 aa  126  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.71 
 
 
4836 aa  126  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.2 
 
 
1706 aa  125  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
12741 aa  124  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  27.86 
 
 
6211 aa  123  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  28.65 
 
 
2145 aa  121  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 
2812 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  30.33 
 
 
1699 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  32.18 
 
 
4791 aa  120  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  33.48 
 
 
3508 aa  120  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.34 
 
 
5839 aa  119  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.19 
 
 
1019 aa  119  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  38.79 
 
 
8871 aa  118  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  44.3 
 
 
2132 aa  117  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  37.08 
 
 
1838 aa  115  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  38.18 
 
 
6678 aa  112  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  41.07 
 
 
2001 aa  112  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  41.18 
 
 
1502 aa  112  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  43.24 
 
 
2461 aa  112  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.02 
 
 
2807 aa  110  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 
369 aa  109  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.33 
 
 
5442 aa  109  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  34.44 
 
 
991 aa  108  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.47 
 
 
3954 aa  106  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.18 
 
 
1066 aa  103  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  34.43 
 
 
998 aa  102  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.74 
 
 
2768 aa  102  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.91 
 
 
3758 aa  101  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  37.34 
 
 
922 aa  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  38.56 
 
 
3714 aa  100  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  33.22 
 
 
6662 aa  100  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.13 
 
 
938 aa  100  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.93 
 
 
3066 aa  100  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.88 
 
 
6779 aa  99.8  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  34.27 
 
 
2802 aa  99  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.21 
 
 
1512 aa  99.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.88 
 
 
6683 aa  99.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.16 
 
 
940 aa  99  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  30.14 
 
 
2153 aa  98.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  29.07 
 
 
5123 aa  98.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  33.61 
 
 
8321 aa  98.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  39.07 
 
 
824 aa  98.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  37.44 
 
 
3089 aa  97.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.02 
 
 
7284 aa  95.5  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.81 
 
 
1867 aa  95.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  34.93 
 
 
337 aa  95.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.69 
 
 
5769 aa  94  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.77 
 
 
4285 aa  93.6  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 
1855 aa  93.2  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  39.61 
 
 
492 aa  92.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  32.86 
 
 
426 aa  92.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  35.96 
 
 
1911 aa  92.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.23 
 
 
3427 aa  90.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.07 
 
 
5787 aa  90.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 
4334 aa  89.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  41.41 
 
 
3193 aa  89  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>