263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2357 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 850 aa  1700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  84.58 
 
 		 761 aa  798    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  95.38 
 
 		 994 aa  1092    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  42.22 
 
 		 2153 aa  274  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  40.87 
 
 		 1597 aa  251  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  40.11 
 
 		 2074 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  43.56 
 
 		 892 aa  235  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.28 
 
 		 3927 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  43.58 
 
 		 2377 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  37.57 
 
 		 1269 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  42.59 
 
 		 1269 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38.12 
 
 		 4978 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.45 
 
 		 1268 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  38.99 
 
 		 2839 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.28 
 
 		 5745 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  38.39 
 
 		 3477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.29 
 
 		 3816 aa  184  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.03 
 
 		 721 aa  184  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  32.55 
 
 		 1367 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  38.57 
 
 		 2816 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.31 
 
 		 1884 aa  179  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  37.4 
 
 		 3474 aa  178  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.86 
 
 		 3089 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.73 
 
 		 2114 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  47.98 
 
 		 715 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.6 
 
 		 1363 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.73 
 
 		 3191 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.79 
 
 		 3363 aa  157  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 		 3699 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 2507 aa  154  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.88 
 
 		 2767 aa  151  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.87 
 
 		 4848 aa  150  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.64 
 
 		 4854 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  36.86 
 
 		 1867 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.99 
 
 		 369 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.62 
 
 		 3699 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.22 
 
 		 2522 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  35.71 
 
 		 2503 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.34 
 
 		 16322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.16 
 
 		 1750 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.7 
 
 		 2476 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.57 
 
 		 4220 aa  128  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.33 
 
 		 2555 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1416 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 4122 aa  121  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.47 
 
 		 814 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.75 
 
 		 1706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.34 
 
 		 2807 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2353 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  37.86 
 
 		 1911 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  33.54 
 
 		 7284 aa  111  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.64 
 
 		 1502 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.92 
 
 		 3396 aa  109  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30 
 
 		 3544 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 		 1215 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.77 
 
 		 1215 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.77 
 
 		 1215 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 1410 aa  104  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 1410 aa  104  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.77 
 
 		 1215 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.77 
 
 		 1215 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.01 
 
 		 2715 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  35 
 
 		 1109 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.2 
 
 		 8321 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.01 
 
 		 9867 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  36.26 
 
 		 1408 aa  93.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.86 
 
 		 16311 aa  91.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.12 
 
 		 1712 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  36.23 
 
 		 570 aa  91.3  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1061 aa  90.9  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  26.52 
 
 		 5769 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.5 
 
 		 1066 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.54 
 
 		 1779 aa  87.4  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.33 
 
 		 2542 aa  87.4  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  32.84 
 
 		 1428 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  28.9 
 
 		 994 aa  84  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.71 
 
 		 4798 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  55.42 
 
 		 755 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1699 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  32.48 
 
 		 891 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 1422 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  28 
 
 		 2145 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.06 
 
 		 5094 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  26.84 
 
 		 2056 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.54 
 
 		 3758 aa  77.4  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1126 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  27.92 
 
 		 991 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.93 
 
 		 4231 aa  76.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1752 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1949 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.07 
 
 		 1063 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1879 aa  75.5  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  43.62 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.18 
 
 		 1286 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.61 
 
 		 11716 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  27.05 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  33.53 
 
 		 1011 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  29.39 
 
 		 6211 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.07 
 
 		 1394 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>