225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000324 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  48.27 
 
 		 3263 aa  2123    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  79.06 
 
 		 6211 aa  6636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  100 
 
 		 5123 aa  9950    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 		 5009 aa  586  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  31.07 
 
 		 7233 aa  560  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  29.98 
 
 		 6006 aa  499  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  32.96 
 
 		 7919 aa  437  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.62 
 
 		 5769 aa  327  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  31.27 
 
 		 2825 aa  319  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 4876 aa  244  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  25.44 
 
 		 3333 aa  213  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 		 3184 aa  161  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  27.41 
 
 		 2159 aa  151  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.58 
 
 		 2887 aa  147  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  25.46 
 
 		 7679 aa  140  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  30.69 
 
 		 4748 aa  132  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  26.33 
 
 		 2524 aa  116  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  40.65 
 
 		 2743 aa  110  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 3363 aa  98.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 1232 aa  97.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1806 aa  96.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  37.06 
 
 		 4848 aa  93.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  37.68 
 
 		 5094 aa  91.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  48.89 
 
 		 2890 aa  90.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 		 3038 aa  90.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  28.16 
 
 		 2125 aa  87.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  25.08 
 
 		 2336 aa  85.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  40.85 
 
 		 2042 aa  83.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.55 
 
 		 16322 aa  80.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  23.47 
 
 		 2567 aa  79  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.46 
 
 		 1428 aa  78.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  38.24 
 
 		 2251 aa  77  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1538 aa  76.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  35.34 
 
 		 4285 aa  74.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.68 
 
 		 2239 aa  73.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  48.81 
 
 		 2542 aa  73.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 		 5787 aa  73.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  48.24 
 
 		 4678 aa  72.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.07 
 
 		 2812 aa  71.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  23.26 
 
 		 3259 aa  71.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.28 
 
 		 4836 aa  71.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1111 aa  70.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1121 aa  70.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.18 
 
 		 5444 aa  70.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  36.36 
 
 		 1166 aa  70.1  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.93 
 
 		 5962 aa  69.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  39.05 
 
 		 6779 aa  68.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  39.05 
 
 		 6662 aa  68.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.05 
 
 		 6683 aa  68.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.97 
 
 		 5839 aa  67.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  34.93 
 
 		 8682 aa  67.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1553 aa  67  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  45.88 
 
 		 1883 aa  66.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36.23 
 
 		 8321 aa  66.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  34.25 
 
 		 9030 aa  66.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  24.82 
 
 		 5020 aa  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.55 
 
 		 2555 aa  66.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  23.67 
 
 		 2784 aa  65.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45 
 
 		 4106 aa  65.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  47.44 
 
 		 5218 aa  64.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.18 
 
 		 4854 aa  64.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  39.82 
 
 		 858 aa  64.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.58 
 
 		 2768 aa  64.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  51.47 
 
 		 5442 aa  63.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.9 
 
 		 7149 aa  63.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1424 aa  63.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.22 
 
 		 2377 aa  63.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.5 
 
 		 874 aa  63.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  49.33 
 
 		 709 aa  63.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  33.56 
 
 		 6753 aa  63.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  30.94 
 
 		 4214 aa  63.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.87 
 
 		 11716 aa  62.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  24.49 
 
 		 2353 aa  62  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  35.34 
 
 		 565 aa  61.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1699 aa  61.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 		 2452 aa  61.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.34 
 
 		 1839 aa  60.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  33.58 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.67 
 
 		 2704 aa  59.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  40.21 
 
 		 901 aa  60.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 4122 aa  59.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  41.11 
 
 		 768 aa  59.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.36 
 
 		 2133 aa  59.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 		 2198 aa  59.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.04 
 
 		 2346 aa  58.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.16 
 
 		 8871 aa  58.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 		 510 aa  58.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  46.05 
 
 		 547 aa  58.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.05 
 
 		 998 aa  58.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  38.39 
 
 		 1202 aa  58.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  25.58 
 
 		 1141 aa  57.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  40.21 
 
 		 889 aa  57.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  36.45 
 
 		 2701 aa  57.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  49.3 
 
 		 856 aa  57.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 		 221 aa  57  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  36.04 
 
 		 1610 aa  57  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  38.89 
 
 		 3209 aa  57  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  32.11 
 
 		 998 aa  57  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21281  hypothetical protein  46.34 
 
 		 741 aa  57  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.419121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.19 
 
 		 1599 aa  57  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>