85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1846 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  33.61 
 
 
6006 aa  809    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 
5009 aa  666    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
4876 aa  9628    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  41.71 
 
 
4748 aa  1321    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  34.81 
 
 
7233 aa  1551    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  31.04 
 
 
2825 aa  523  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  30.84 
 
 
7919 aa  436  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.53 
 
 
6211 aa  293  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  38.56 
 
 
1232 aa  273  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  28.12 
 
 
5123 aa  241  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  29.09 
 
 
2329 aa  237  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 
3184 aa  221  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  26.45 
 
 
5769 aa  127  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  26.73 
 
 
3263 aa  106  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 
3396 aa  96.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.51 
 
 
5098 aa  78.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.06 
 
 
2807 aa  74.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
3954 aa  72.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.93 
 
 
7149 aa  70.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.79 
 
 
3474 aa  68.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 
3363 aa  68.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  37.01 
 
 
4848 aa  68.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  47.22 
 
 
1706 aa  67.4  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  33.57 
 
 
2198 aa  65.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36 
 
 
4978 aa  63.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  27.92 
 
 
4854 aa  63.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  27.43 
 
 
4285 aa  63.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  35.61 
 
 
1269 aa  63.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.39 
 
 
1597 aa  62.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  36.72 
 
 
1269 aa  61.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 
1268 aa  61.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  35.88 
 
 
5745 aa  60.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  39.84 
 
 
1867 aa  60.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.33 
 
 
2887 aa  60.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.12 
 
 
814 aa  59.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.52 
 
 
892 aa  58.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.44 
 
 
3927 aa  58.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 
2524 aa  57.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  44.19 
 
 
2839 aa  57.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  32.55 
 
 
4451 aa  57.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 
16322 aa  57  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  24.04 
 
 
3333 aa  57  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.32 
 
 
1109 aa  56.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  33.01 
 
 
7072 aa  56.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.56 
 
 
824 aa  56.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.28 
 
 
3816 aa  56.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.63 
 
 
3191 aa  57  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.17 
 
 
2377 aa  55.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
1283 aa  55.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  31.7 
 
 
2336 aa  55.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.28 
 
 
2074 aa  54.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.2 
 
 
2812 aa  54.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
2507 aa  54.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.96 
 
 
1884 aa  55.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  26.96 
 
 
3508 aa  54.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  34.86 
 
 
1141 aa  54.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.23 
 
 
2239 aa  54.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  49.15 
 
 
1035 aa  53.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.74 
 
 
4220 aa  53.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  24.76 
 
 
3229 aa  53.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  50.94 
 
 
1518 aa  53.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  37.3 
 
 
721 aa  52.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.41 
 
 
2816 aa  52  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  35.63 
 
 
2768 aa  52  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  29.6 
 
 
1538 aa  51.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  30.43 
 
 
542 aa  51.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  39.18 
 
 
974 aa  51.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.76 
 
 
1292 aa  51.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  48.28 
 
 
3477 aa  51.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  31.65 
 
 
2353 aa  50.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.23 
 
 
1286 aa  50.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.94 
 
 
1066 aa  49.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.75 
 
 
6662 aa  49.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  49.02 
 
 
3471 aa  49.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.75 
 
 
6683 aa  49.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.75 
 
 
6779 aa  49.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  29.37 
 
 
1350 aa  48.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.37 
 
 
1806 aa  48.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 
3038 aa  48.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 
994 aa  48.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.36 
 
 
850 aa  47.8  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 
761 aa  47.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.06 
 
 
2114 aa  47.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.85 
 
 
369 aa  47  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.43 
 
 
4122 aa  47  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>